在修学旅行途中遭遇重大车祸后，理树和伙伴们被困在一个只有他们的校园世界里。为了寻找“这个世界的秘密”，他们不断重复着同样的日常。第二季中，随着恭介的指引逐渐失效，理树必须独立面对每个人内心的创伤。铃的秘密被揭开，世界的真相原来是大家为了拯救重伤的理树和铃而创造的虚拟意识空间。最终，理树选择面对残酷的现实，唤醒所有人。
为了对抗世界的秘密，理树和Little Busters的伙伴们陷入了无尽的循环。
作为Key社催泪弹的续作，前半段的日常依然搞笑，后半段的真相揭露让人头皮发麻。它不是单纯的卖惨，而是讲述了面对绝境时友情的极限力量，结尾那句“世界的秘密就是友情”足以让人泪崩。
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